Sinh ra tại Yugoslavia, mẹ của anh là người Czech và cha Bosniak của anh từng là người may đồ cho Tito. Gia đình anh đã trốn khỏi đất nước sang Pháp vào năm 1960, nơi Enki học tiếng Pháp và khám phá điện ảnh và truyện tranh. Vào năm 1971, anh giành chiến thắng trong một cuộc thi do tạp chí truyện tranh nổi tiếng Pilote tổ chức với câu chuyện đầu tiên của mình có tên "L'appel des étoiles". Nó được xuất bản trên Pilote và sau đó được tái phát hành với tựa đề "Le bol maudit", và nó cho phép Enki Bilal bắt đầu làm việc cho tạp chí bằng cách vẽ các nhà chính trị gia. Anh sau đó gặp Pierre Christin (khi đó là nhà kịch bản của "Valérian" trên Pilote) và bắt đầu hợp tác với anh từ năm 1975 với tác phẩm "La croisières des oubliés". Năm 1979, họ cho ra mắt "Les Phalanges de l'Ordre Noir", nhận được sự hoan nghênh từ giới phê bình và giải thưởng Prix RTL. Bilal cũng vẽ "Exterminateur 17" vào năm 1978 cho tạp chí Metal Hurlant, với kịch bản của Jean-Pierre Dionnet (sau đó được phát hành dưới dạng album vào năm 1989).Enki Bilal phát hành cuốn truyện tranh đầu tiên của mình, "La foire aux immortels", vào năm 1980, đó là tập đầu tiên trong "Nikopol Trilogy" nổi tiếng của anh (tiếp theo là "La Femme piège" vào năm 1986 và "Froid équateur" vào năm 1993, cuốn truyện tranh đầu tiên được chọn là cuốn sách hay nhất trong năm bởi tạp chí văn học Lire). Anh cũng thiết kế poster cho bộ phim "Mon onlce d'Amérique (1980)" của Alain Resnais. Hai năm sau, anh hợp tác với Resnais không chỉ làm poster mà còn tưởng tượng ra những bộ trang phục và thiết kế sản xuất của bộ phim "Life Is a Bed of Roses (1983)", sử dụng kỹ thuật vẽ bằng kiếng. Anh cũng tiếp tục hợp tác với Christin cho Dargaud Editions, chủ yếu phát hành "Partie de Chasse", nhận được nhiều lời khen ngợi từ báo chí Pháp vào năm 1983. Năm 1985, anh thực hiện một số nghiên cứu đồ họa cho bộ phim "The Name of the Rose (1986)" của Jean-Jacques Annaud. Sau đó, anh gặp Patrick Cauvin (còn được gọi là Patrick Cauvin) với người anh hợp tác cho cuốn sách "Hors jeu" (1986), là một cuốn sách gồm văn bản và minh họa về chủ đề thể thao. Năm 1987, anh nhận được giải thưởng danh giá đầu tiên tại Liên hoan truyện tranh Angoulême. Năm sau đó, anh trưng bày tác phẩm của mình tại Palais de Tokyo (Paris), bên cạnh các tác phẩm của nhà nhiếp ảnh Josef Koudelka và nghệ sĩ Guy Peellaert.Bước tiếp theo trong tham vọng điện ảnh của anh là "Bunker palace hôtel (1989)", bộ phim đầu tiên của anh như một đạo diễn, được đồng viết kịch bản với Christin, có sự tham gia của Jean-Louis Trintignant và Carole Bouquet. Anh cũng làm việc lần đầu tiên cho các buổi biểu diễn sân khấu, tạo ra trang phục và thiết kế sản xuất của opera đương đại "OPA mia" của Denis Levaillant tại Avignon vào năm 1990, và cho ballet "Roméo et Juliette" của Sergei Prokofiev (được Angelin Preljocaj biên đạo) ở Lyon vào năm 1991. Sau một số lượng nhỏ các cuốn truyện tranh phát hành hoặc tái phát hành và triển lãm ("Transit" tại Grande Arche de la Défense, Paris năm 1992; "Bleu Sang" tại Paris năm 1994), Bilal đạo diễn bộ phim thứ hai của mình, "Tykho Moon (1996)", cũng có sự tham gia của Trintignant, cũng như Julie Delpy, Michel Piccoli và Richard Bohringer. Lần này, kịch bản được đồng viết bởi Dan Franck và âm nhạc được sáng tác bởi Goran Vejvoda. Bilal cũng phát hành một cuốn sách đồ họa dựa trên bộ phim của mình. Năm 1998, anh bắt đầu một bộ ba mới với "Le Sommeil du montre" (Editions Les Humanoïdes Associés), sau đó là cuốn sách đồ họa "Un siècle d'amour" cùng với Dan Franck vào năm 1999, "Le Sarcophage" cùng với Christin vào năm 2000 và tập hai trong bộ ba của anh, "Trente-deux Décembre", vào năm 2003. Anh cũng tổ chức một số triển lãm: "Magma" (Naples, 2000), "Le Sarcophage" (Paris, 2000), "enkibilalandeuxmilleun" (Paris, 2001, sau đó là Sarajevo, Belgrade, Lièges, Cherbourg và Barcelona). Nhà sản xuất Charles Gassot, người là fan của công việc của Bilal, quyết định sản xuất một dự án liều lĩnh và cho phép Bilal có một ngân sách lớn hơn (khoảng 22 triệu Euro) cho bộ phim mới của anh: "Immortal (2004)". Bộ phim dựa trên hai tập đầu tiên của "Nikopol Trilogy" và Bilal yêu cầu nhà văn khoa học viễn tưởng Serge Lehman giúp đỡ anh viết kịch bản. Bộ phim kết hợp liều lĩnh giữa nhân vật số và người thật, với sự tham gia của Linda Hardy, Thomas Kretschmann và Charlotte Rampling. Bilal cũng mời Jean-Louis Trintignant, Frédéric Pierrot và Yann Collette lần thứ ba, và Vejvoda làm âm nhạc một lần nữa.
